方春

FANG chun

方春,女,1981年4月出生,湖北荆州人,工学博士,副教授,硕士生导师,2014年3月毕业于日本早稻田大学。2017年至2019年在日本东京大学任JSPS研究员,2023年3月至2024年3月在早稻田大学做访问学者。2021年7月至今任教于北京石油化工学院信息工程学院,现在计算机科学与技术系工作。主要研究领域为大数据分析、智能计算、生物信息学等研究。作为课题负责人完成国家自然科学基金青年基金1项、日本学术振兴会JSPS学者项目1项,山东省自然科学基金青年项目1项、留学基金委访学项目1项;参与国家自然科学基金和省部级项目7项;指导学生完成国家级大学生创新创业训练项目2项,发表科研论文40余篇,其中SCI收录论文期刊论文20余篇。 

I. 主要研究工作

1. 图像、文本大数据分析和模式识别

2. 智能计算方法在生物数据中的应用研究。

 II. 承担科研项目

1. 国家留学基金委访问学者计划(项目号:202208110076),项目负责人,2023.03-2024.02

2. 企业横向项目:智能洗涤支持软件和技术开发,项目负责人,2025.01-2027.12

3. 日本国家基金--JSPS特别研究员项目:膜蛋白质天然变性领域的预测和分析(合作单位:东京大学)(项目号:P17050),项目负责人,2017.8-2019.8

4. 国家自然科学基金青年基金项目:天然无序蛋白质无序区域及其分子识别特征域的预测算法研究(项目号:61602280),项目负责人,2017.01-2019.12

5. 山东省自然科学基金青年基金项目:基于序列信息的天然无序蛋白质功能位点的预测(项目号:ZR2014FQ028),项目负责人,2015.01-2017.12,

6. 山东省软件工程重点实验室(山东大学)联合开放基金项目、固有无序蛋白质功能位点的识别研究。项目负责人,2016.10-2018.09.

 III. 代表性学术论文

1.   Fan Zhang, Jinfeng Li, Chun Fang*, DeepTree-AAPred: Binary tree-based deep learning model for anti-angiogenic peptides prediction. Journal of Molecular Graphics and Modelling, 2025,108982(137):1-10.

2.   YiMing Wang,Chun Fang*, Cycle-ESM: Generation-assisted classification of antifungal peptides using ESMprotein language model,Computational Biology and Chemistry2024108240113):1-10.

3.   Fan Zhang, Jinfeng LiZhenguo WenChun Fang*, FusPB-ESM2: Fusion model of ProtBERT and ESM-2 for cell-penetrating peptide prediction       Computational Biology and Chemistry,20241(111):1-9.

4.   Chun Fang*, Jiasheng He, Hayato Yamana. MoRF_ESM: Prediction of MoRFs in disordered proteins based on a deep transformer protein language model,Journal of Bioinformatics and Computational Biology,2024,2(22):1-17.

5.   Jiasheng He, Shun Zhang, Chun Fang*, PPII: Predicting polyproline type II helix  structure based on amino acid indexes with an  improved BiGRU-TextCNN model,2023,JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY,5(21):2350022-1-19.

6.   Fan Zhang, Ruiqing Yan, Jinfeng Li, Jiasheng He,Chun Fang*, GAMFlow: Global Attention-Based Flow Model for Anomaly Detection and Localization IEEE ACCESS2023,11(11):116608-116621

7.   Chun Fang, Yoshitaka Moriwaki, Caihong Li and Kentaro Shimizu. MoRFPred_en: Sequence-Based Prediction for MoRFs Using an Ensemble Learning Strategy [J], Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2020, 17(6):1-15.

8.   Chun Fang, Yoshitaka Moriwaki, AikuiTian, Caihong Li and Kentaro Shimizu.Identifying short disorder-to-order binding regions in disordered proteins with a deep convolutional neural network method [J]. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2019, 17(1):1-16.

9.   Chun Fang, Yoshitaka Moriwaki, Caihong Li, and Kentaro Shimizu, Prediction of Antifungal Peptides by Deep Learning with Character Embedding[J]. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2019,12:21-29.

10.  Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana. Condensing position-pecific scoring matrixs by the Kidera factors for ligand-binding prediction[J]. International Journal of Data Mining and Bioinformatics. 2015, 12(1), 70-84.

11. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, Simplified Sequence-based method for ATP-binding Prediction Using Contextual Local Evolutionary Conservation [J], Algorithms for Molecular Biology, 2014, 9(7):1-16.

12.  Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, Conservation Patterns of proteins and Its Influence on Identifying Protein Functional Sites [J]. Journal of Bioinformatics and Computational Biology,2014,12(5) 1440003:1-18.

13. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, MFSPSSMpred: Identifying short disorder-to-order binding regions in disordered proteins based on contextual local evolutionary conservation [J]. BMC bioinformatics, 2013,14 (300):1-16.

14.  Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, SCPSSMpred: A General Sequence-based Method for Ligand-binding Site Prediction [J], IPSJ Transactions on Bioinformatics, 2013, 6: 35-42.

IV. 招生信息

拟每年招收控制科学与工程学术型硕士1名,电子信息专业硕士1名。